根据秋季特点，栽培方面应注意以下几点：
培养料发酵 力求均匀
基料发酵应注意发酵均匀，除双孢菇、鸡腿菇等必须进行发酵料播种的品种以外，平菇、姬菇等也有应用，多年的实践表明：发酵料栽培中常见的问题就是发酵不均匀，熟化度不一，含水率不一，甚至出现厌氧发酵等各种非正常情况，从而造成栽培效果不理想。因此，应注意翻堆原则：内外均匀、上下均匀，根据发酵温度和天气状况，每次翻堆应根据料的水分变化予适当补水；双孢菇的二次发酵，一定要达到温度要求，并保持规定的时间，否则，极有可能大量发生鬼伞，导致生产的失败。
气温较高 注意虫害
秋季气温尚高，大多地区的3月份直至10月底，菇蚊菇蝇类害虫基数一直较高，尤其粪蝇更是活跃，基料拌料或发酵期间，它们趋味而来，近料产卵，使得生料栽培时带卵播种，发酵料播种时活虫进袋或上床，发菌期间便会形成危害，导致“退菌”，即开始阶段菌丝浓密，而后菌丝越来越少，直至完全退菌。因此，拌料前先清理周边环境，喷洒一次药液。拌料或装袋期间，如有菇蚊菇蝇类，则喷洒药物驱杀，并尽快完成播种。
湿度较大 注意防杂
秋季生产，空气相对湿度及地面水分均较大，如在大棚发菌，遇有高温或通风不好，发生污染的概率相当大，这也就是早秋季节为何鲜菇上市量较少的主要原因之一；污染主要是常见的木霉、曲霉、毛霉等，熟料栽培时，链孢霉则是“头号杀手”，一旦形成蔓延，将导致栽培失败。因此，发菌棚启用前严格消毒，清理干净后，喷洒药物，然后揭掉草苫，令其晒棚，高温条件下，药物充分发挥作用，2天后，覆盖草苫降温，将地面撒一层石灰粉，之后即可将播种后的菌袋移入进入发菌期；发菌期间，应喷洒药物预防。注意所选药物应是无公害的，对人安全的药物。
严格控制 注意剔杂
发菌期间，严格进行剔杂，一旦发生污染，立即将污染菌袋移出棚外适当处理，以防蔓延。
长速较快 适时采收
早秋季气温对出菇很是合适，子实体发生较快。由于长速较快，故应及时采收，原则是采早不采晚，宁愿因采早而减少产量，也不能因采晚而使之老化。老化菇不但食用口感差，而且还浪费大量基料营养，并且，鸡腿菇等品种，一旦采晚，便会开伞自溶，丧失商品价值。
