在南方诸省，由于小麦、玉米较少，所以可以利用稻谷来制作谷粒菌种，效果也很理想。
配方：稻谷92％、麸皮5％、石膏2％、石灰1％。
制作方法和注意事项：
1、选用上年的晚稻谷，烈日下暴晒1－2天，清水洗净，放入PH值13的石灰水中浸泡。将谷粒浸没在水面下,夏季在24小时左右，秋、冬季在36－40小时，使米粒充分湿润，捞起沥干，晾干表面的水分，然后拌入石膏粉及石灰粉后装瓶，并在0.2兆帕的压力下高压灭菌1.5－2小时，常压灭菌需在100℃以上保持10小时以上。
2、瓶口要加封口料。谷粒培养基表面松散，易失水，不利于菌丝的萌发和定植。为了使接种后的菌丝萌发及定植快，在培养料的表面加一层约2CM厚的常规散碎的料（如棉壳、木屑等培养料），用石灰水调节PH值至8－8.5，湿度掌握用手紧捏有4－5滴水下滴为宜。封口料有一定的含水量，利于菌丝的定植，发菌快，封口早，杂菌就不易侵入，有利于提高菌种的成品率。
3、用稻谷制菌种，淀粉及糖份较丰富，容易酸败变质，污染杂菌，故应注意无菌操作。高温季节菌种的摆放要注意做到疏散、遮光、降温、通风及环境消毒，以确保菌种的成品率。在管理上的关键是降温和环境消毒。谷粒菌种的摆放，在自然温度下，尽量做到不挤叠在一起。因为，菌丝生长发育过程中，会释放出热量，如过分挤叠在一起，会使小环境的温度偏高，不利于菌丝的生长。温度偏高又会使培养基变质，导致污染。谷粒菌种培养期间，环境应注意清洁、干燥。
