液体种接种后菌丝萌发正常但不吃料的原因较多，出现菌丝不吃料现象后，及时分析、对比，找出原因，以免耽误生产。
栽培培养基发酸变质
料变酸原因：培养料加水搅拌后，未及时装瓶、装袋灭菌，料内除锯末外，加入了适宜霉菌生长的麦麸、豆饼粉等，温度超过20℃以上，不通风，拌料闷堆到上锅灭菌超过15小时，料极易发酸。
装袋时要当天拌料，当天装袋，当天灭菌。切忌拌完料不及时装袋，装完袋后又不及时灭菌，或未装净的料堆放在室内，第二批拌料时又加入了这些老料，这些料就成了第二批料发酸的“面引子”，所以剩料一定要严格检查发酸变质没有，未装净的料应移到低温通风的地方或放在日光下晒一下再加入。
原料问题
锯末从加工厂运回来，直接堆成大堆，料发烧捂堆后，不摊开晒干用，而是直接用来拌料装袋使用。料发烧是微生物生长繁殖所致，直接使用这样的锯末，锯末内大量存活繁殖的微生物遇到合适的温湿度加速生长，最后导致料发酸变质。
另外，有时培养料不是变酸，而是散发腥辣等气味，这是因麦麸陈旧酸值过大，或新鲜杨木锯末挥发出的异味，或松木锯末过多，或灭菌时升温慢，或拌料时加的水已变质导致料腥、臭、辣、苦。
采取措施：拌料前严格选择原料，含有油脂、芳香味、乙醇等物质的松、杉、柏、桉、香樟、速生杨树等锯末不应鲜用直接做培养基。其它阔叶树种锯末应堆成大堆，让其自然发酵，待温度达到60—80℃，保持3—4天左右，锯末变成褐色，散堆降温、晒干备用。经过这样处理的锯末，木材组织死亡的快，利于腐生型黑木耳菌丝生长。在堆堆发酵过程中，锯末中大量嗜热型微生物生长繁殖，使料内温度高达60—80℃，用微生物繁殖产生的热量杀死微生物。这样锯末中一些易被微生物生长吸收的糖类在发酵中被微生物消耗掉，因此在以后的生长中，适宜杂菌生长的营养缺乏使它的生长受到抑制，又因大量微生物的菌体蛋白保留在锯末内，所以又增加了锯末的营养。
灭菌不彻底
灭菌时间短、温度低，没达到杀死微生物的程度，致使一些嗜热型微生物生长繁殖，抑制菌丝的生长。
灭菌初期要大火块烧，最好3个小时内达到100℃，如4个小时还达不到，袋内的料往往发酸变质。使用新鲜的麦麸或稻糠，拌料时要加新鲜的自来水、河水、井水（不应用放置过久混浊变质的水，死水泡子的水，带有异味的水）。
装料过满 棉塞触料 袋内没有空间
菌丝刚萌发还未向料中生长，菌种块的水分就被棉塞吸干了，刚萌发的菌丝因失去菌种块水分的供应，袋内缺氧，棉塞又将刚萌发的菌丝水分吸干，菌丝就失去了向料中生长的能力，所以不向料中生长。
采取措施：17×33公分的袋，料装至17－18公分处，料面离棉塞必须有3－5公分的空间距离。这个空间是交换空气的空间。这样利于袋内空气流通，保证菌丝生长对新鲜空气的需要。有条件的栽培户应用无棉封盖代替棉塞。
培养基PH值不当
碱值大对抑制霉菌有积极作用，但碱值过大菌丝是难以适应的。在拌料时要严格掌握生石灰的使用量；要严格鉴别石膏和白灰的区别，防止误将白灰做石膏，反复添加致使碱值偏大，抑制菌丝的生长。
培养基内氮源、维生素等营养物偏低
培养基内由于麦麸、豆饼粉等比例偏低，造成氮源、维生素含量不够，满足不了菌丝生长的需要，致使培养基内营养物减少菌丝难以吃料。
